医疗器械经营企业许可证的办理流程主要包括以下几个步骤：

准备申请材料：需要准备相关资料，包括企业基本情况介绍、经营设施和设备目录、经营质量管理制度和流程、企业法人、企业负责人、质量管理人的相关学历、职称或工作经历证明等资料。

提交申请：将申请材料提交给当地食品药品监督管理部门。

审查：食品药品监督管理部门对申请材料进行审查，包括对申请表格的完整性、真实性和规范性进行审查，对企业经营条件、质量管理体系等进行现场核查。

审批：经过审查后，食品药品监督管理部门作出是否准予许可的决定。如果准予许可，则颁发医疗器械经营企业许可证。

领取证书：申请人可以到食品药品监督管理部门领取医疗器械经营企业许可证。

需要注意的是，不同国家和地区的医疗器械经营企业许可证的办理流程可能有所不同，具体要求可以查询当地的相关法规和标准。此外，在办理过程中需要遵守相关法规和标准的要求，确保申请材料的真实性和完整性，否则可能会被驳回或撤销许可证。